仲恺遇刺震动整个广州，国民政府、国民党中央、军开紧急联席会议，当天即决定广州戒严，成立由汪精卫、许崇智、蒋介石为首的特别委员会，授予党政军警全权，以加强对局面的控制，又成立廖案检察委员会，由陈公博、周恩来、杨安、吴铁城等人担任委员，其中陈公博负主要责任，负责协助特别委员会追查凶手。
庄继华踏入情报科时，看到的贺衷寒不再是那个意气风发，充满自信的青年军官，而是是一个脸色苍白憔悴、陷入自责与后悔的年青人。自从廖仲恺遇刺的消息传来，贺衷寒即陷入深深的自责中，太疏忽了，朱卓文在慰园的奇怪举动没有引起他的重视，胡毅生、林直勉等人的动作让他放松了警惕。
庄继华带兵回到广州后，蒋介石立刻命令他把部队交给胡宗南，让他去重新接管情报科。庄继华这时已经平静下来，既然事情已经发生，既然历史没有改变，那么就让历史按照原来的轨迹发展吧。
得知庄继华接管情报科后，贺衷寒知道蒋介石这是对自己不满，虽然他可以找点理由来推托，比如情报科成立人手太少，事务太多等等，可是他不想这样作，他认为自己应该接受这样的结果，他对廖党代表的遇刺负有责任，因为庄继华提醒过他，甚至为他拟定了方略，是他胆怯了，退缩了。
贺衷寒把最近收集到的所有有关活动的情报全部移交给了庄继华，庄继华连夜研究，第二天就把一批需要逮捕的名单交给了蒋介石。
名单上排在头名的就是主要疑凶朱卓文，然后是胡毅生、林直勉，然后是梁鸿楷、林树巍、杨锦龙、张国、梁士择等粤军将领。
“这么多人？有什么证据吗？”蒋介石拿着名单问庄继华，虽然他公开宣称要报仇，可是在具体执行上却很慎重。
“情报科的情报表明，这些人经常在慰园、文华堂俱乐部、胡汉民的家中聚会商议，他们参与了策划暗杀的阴谋。”尽管一夜没睡。庄继华依然精神饱满。
“这些人都是党政军的重要人物，我需要直接证据。”蒋介石冷静的说，胡毅生、林直勉都是胡汉民地亲信，梁鸿楷、林树巍等人是许崇智的部下，要是没有过硬的证据，引发他们的反扑，后果就很难说。
“是，明天我就把证据交给校长。”庄继华毫不犹豫的说：“不过我需要一个条件。”
“你说。”
“现在案件主要是依靠公安局的力量在侦办。可吴铁城我信不过他，我想我们自己来侦办这个案件。所以我需要案件侦办权。”
“不行。”蒋介石考虑之后拒绝了庄继华的要求，蒋介石心里很清楚，吴铁城是公子孙科的人。孙科也是想倒廖地，甚至他也有嫌疑，不过正是如此才必须让他的人去查。
“校长！”庄继华突然有些激动的叫道…。
“文革，我知道你想说什么。也知道你想作什么。”蒋介石摆手制止庄继华的话，他猛然站起来：“廖党代表遇害，我也很愤怒，也很想报仇。可是我不能因此毁了国民党。毁了黄埔。”蒋介石痛苦地用手撑住办公桌，他眼眶微红：“党代表遇害，背后肯定有人指使。而且肯定在党内身居要职。甚至有可能是党内的领导同志。可正因为这样，我们不能直接插手调查。必须让别人去查。我们去查就是查出证据也可以被人说成是假的，我们抓人就可以被看作夹私报复。…。查，只能让他们去查，我们监督。”
这就是政治。庄继华明白了，蒋介石首先考虑的不是彻底查清案情，而是如何获取最大利益。他肯定是要借此机会除掉一些对手，可现在黄埔系实力并没有压倒优势，因此必须占据政治高点，也就是所谓地法统，让非黄埔系的人去查，只要查出线索，那么蒋介石就能名正言顺的抓人。
“要是有人敷衍了事呢？”虽然想明白了其中的道理，庄继华依然有些担心，汪精卫孙科会不会隐瞒什么，他感到这个世界好像是个混乱地，可以为所欲为的世界。
“谁敢，”蒋介石冷冷的说：“就是要撇清自己，或者其他人，也得查出些证据。”
其他人，蒋介石指地就是孙科和胡汉民，庄继华心想，他索性干脆挑明：“校长认为孙科和胡汉民有没有可能参与这件事情？”
“孙科肯定没有。”蒋介石直视着庄继华，冷冷地，坚决地，毫不怀疑的答道。没提胡汉民，那么就是说胡汉民……。
“明白了，那我该怎么作？”庄继华当然明白了，孙科身份特殊，他是孙中山地儿子，他若卷入这件案件中，对孙中山的声望的打
致命的。
“你有那些想法？”蒋介石反问道。
“学生认为，既然不能直接明查，我们可以暗查；这是一，其次可以准备对许崇智收网了。”庄继华没有隐瞒直接自己的想法。
“晤，你去办吧。”蒋介石这才满意的点点头，看了情报科的情报后，蒋介石清楚胡汉民已经是死老虎了，真正要对付的是许崇智，可究竟怎么处理许崇智他还没想好，从私交上说许崇智是他的大哥，对他不薄，这要对付了他，以后别人会怎么看他蒋介石。
广州城内空气十分紧张，**在《新青年》《向导》等刊物上连续发表文章，指出廖案是帝国主义者与份子勾结，向革命发动进攻，要求彻查廖案，彻底清除份子，保持革命阵营的纯洁。
国民政府宣布为廖仲恺举行国葬